La temporada 2 presenta nuevas historias y nuevos héroes tras el enfrentamiento apocalíptico en la ciudad de Nueva York. Claire se ha mudado con su padre H.R.G. y su familia al sur de California para ocultar sus habilidades indestructibles. Allí se encuentra con un joven con un secreto propio. Matt gana nueva autoridad en la búsqueda de una fuerza asesina que acecha a los Héroes, mientras que Suresh descubre un virus misterioso que podría erradicarlos a todos. Niki emerge con nueva fuerza, buscando comenzar de nuevo con Micah. Aprendemos el destino final de Peter, Nathan y el malvado Sylar, así como la impactante identidad de un hombre aún más siniestro. Hiro se ha teletransportado al Japón feudal, donde descubre que el héroe de su infancia no es la leyenda que imaginaba. Durante toda la temporada, el exitoso drama explora los secretos de diferentes generaciones de familias de Heroes. A medida que se desarrolla cada capítulo sensacional, no hay resistencia a lo extraordinario.
