En la 2ª temporada, el tema es la Pesadilla Neogenética que en el capítulo 6 Morbius convirtió a Spider-Man en un Monstruo Araña (Spiderfreak), en el 1 y 2 capítulo Los Seis Villanos aparecen grupos, como Seis Villanos, (una formación compuesta por Rino, Shocker, Doc. Octopus, Misterio, el Escorpión y el Camaleón); o en el capítulo 4 El plan de los mutantes los X-Men con la formación sacada de la serie de animación (X-Men). En el capítulo 7 Llega el Castigador aparecen más personajes de Marvel, como The Punisher o Blade, en el capítulo 13 El graznido del Buitre, aparece el Buitre, el cual, en el capítulo 14 La pesadilla final, con la ayuda del Dr. Connors, curaría involuntariamente a Spider-Man de su enfermedad.
14 episodios
Transmitida en FOX
Transmitida desde: 9 de septiembre de 1995
