Varios criminales escapan de la Zona Fantasma y Clark aprovecha para escapar. Kara, la prima de Clark, llega a Smallville. La amistad entre Lex y Clark llega a un punto crítico mientras Lex hace todo lo que está en su poder para conquistar a Lana. Cuando Lana descubre que está embarazada, decide aceptar la propuesta de matrimonio de Lex. Poco después de la boda, Lana descubre la verdad de su condición y el secreto de Clark. Louis hace un cambio de carrera. La Fortaleza de la Soledad es destruida.
22 episodios
Transmitida en WB
Transmitida desde: 28 de septiembre de 2006
23 fotos
Clark es lanzado a la Zona Fantasma y queda sin poderes. Zod, en el cuerpo de Lex, mantiene cautiva a Lana y le exige que le dé un heredero, y comienza sus planes para convertir la Tierra en un planeta como Krypton.
Mientras Clark se esfuerza por enmendar la destrucción que dejó Zod, desarrolla la versión kriptoniana de un resfrío. Tras algunos estornudos destructivos, Clark descubre que posee un nuevo poder: superaliento.
Culpable por la destrucción causada mientras era controlado por Zod, Lex ofrece un baile de disfraces para la caridad. Luisa acepta de mala gana acompañar al multimillonario Oliver Queen al evento. Además, Clark y Chloe persiguen a una criatura femenina que planta semillas en hombres para procrear, y la caza se intensifica cuando la entidad ataca a Jimmy.
Mientras asiste a una recaudación de fondos, Luisa ve a Flecha Verde arrebatar un raro collar de diamantes del cuello de Martha y promete averiguar quién es el hombre detrás del traje. Clark descubre que Flecha Verde es realmente Oliver Queen, quien ha estado robando a los ricos para darles a los pobres.
Lex y Oliver vuelven a la preparatoria para una reunión y se alarman cuando los viejos amigos de Oliver son asesinados en accidentes violentos y misteriosos que de alguna manera apuntan a Duncan. Además, Clark ve fotos satelitales que muestran que otros cuatro cráteres se crearon cuando escapó de la Zona Fantasma y se da cuenta de que otros pueden haberlo seguido.
Clark se emociona al enterarse de que la chica kriptoniana que lo ayudó a salir de la Zona Fantasma, también escapó y ahora está en Villa Chica.
Clark se entera de que a Flecha Verde, cuya identidad pública es Oliver Queen, le dispararon mientras salvaba a una pareja de un robo de auto, pero Oliver niega estar herido. Además, Lana hace un descubrimiento que impactará su relación con Lex.
Clark se entera de que un fugitivo de la Zona Fantasma está en Seattle y mató a la tripulación de un buque de carga taiwanés.
Clark se sorprende al descubrir que su vecino Jed McNally cautiva a migrantes trabajadores y los obliga a trabajar en su granja.
Lana le cuenta a Chloe que duda sobre casarse con Lex, ya que aún siente cosas por Clark, pero una columnista de chismes del Daily Planet, Linda Lake, escribe una historia que detalla su conversación.
Lex captura y tortura a Bart, y ataca a Clark con un meteorito cuando intenta rescatarlo. Una alarmada Chloe pide ayuda a Oliver, y la recién formada liga sale al rescate de Clark y Bart.
Clark se despierta en un hospital psiquiátrico y le dicen que lleva allí cinco años, debido a su elaborada fantasía de que tiene superpoderes. Martha está casada con Lionel, Chloe también es mentalmente inestable y Lana eligió a Clark.
Luisa se aplica lápiz labial hecho de kriptonita roja, lo que provoca que sienta un profundo deseo hacia Clark y se le insinúa. Cuando ambos se besan, la kriptonita roja se transfiere a Clark y elimina sus inhibiciones. Clark irrumpe en la cena de bodas de Lex y Lana, y secuestra a la futura novia.
Tras recibir una fotografía de sí misma vistiéndose en su habitación, Lana se da cuenta de que tiene un acosador y decide esconderse en un lugar inesperado.
Clark y Chloe descubren que Lex usa a Tobias, que quedó ciego por la lluvia de meteoritos, pero con la capacidad de identificar fenómenos por meteoritos. Lana teme que Tobias exponga a Clark y ofrece un trasplante de córnea por su silencio.
El día de la boda de Lex y Lana, Lex recibe una llamada de un médico que amenaza con decirle a Lana la verdad sobre su bebé. Mientras tanto, Clark tienes sus propias dudas.
Clark y Chloe descubren que Titan es la estrella de un club de lucha secreto que transmite sangrientas batallas mortales en Internet. Luisa investiga por su cuenta, pero es capturada y forzada a participar en las luchas.
Después de que Lex descubre que la madre de Chloe, Moira, tiene el poder de controlar a los fenómenos por meteoritos, desarrolla una droga para despertarla de su estado catatónico en un asilo.
Jodi , esposa de un soldado de las Fuerzas Especiales, explota una bomba en un laboratorio secreto de Lex. Lionel es gravemente herido y Lex es tomado como rehén.
En un episodio especial de cine negro filmado parcialmente en blanco y negro, Jimmy ve cómo era la vida en Villa Chica en la década de 1940. Mientras tanto, en la actualidad, Clark descubre por qué Lana se casó con Lex.
Lex trata secretamente de convertir a Wes Keenan en un supersoldado inyectándolo con ADN de fenómenos por meteoritos que ha capturado. Además, Clark intenta convencer a Lana de abandonar a Lex.
Clark descubre que Lionel le dijo a Lana que lo mataría si no se casaba con Lex, y va tras Lionel. Lana le dice a Lex que lo dejará. John Jones regresa para ayudar a Clark a evitar que Lex use el ADN de un fantasma para su ejército de supersoldados.