Cuando las tres piedras son reunidas, se forma la Fortaleza de la Soledad, donde Clark podrá perfeccionar sus habilidades. Renegando su destino, Clark decide ir a la universidad. Lex se obsesiona con el tema de la lluvia de meteoritos después de que Lana encuentra una nave espacial. Cloeh descubre el secreto de Clark y se vuelve su compañera de aventuras. Los experimentos de Lex atraen a un nuevo enemigo que podría poner en peligro Smallville. Lionel se convierte en el nuevo receptor de Jor-El. Clark termina atrapado en la zona fantasma ubicada en el espacio infinito.
22 episodios
Transmitida en WB
Transmitida desde: 29 de septiembre de 2005
23 fotos
Clark desaparece en un vórtice que lo lleva a la Fortaleza de la Soledad. Ahora se enfrenta a Jor-El, que no lo deja volver a Villa Chica.Además, Lana se horroriza cuando ve a dos extraterrestres kriptonianos emerger de una nave espacial en lo que queda de la reciente segunda lluvia de meteoritos.
Jor-El despoja a Clark de sus poderes, lo que lo hace humano. Feliz de ser finalmente normal, Clark busca tener una relación con Lana. Sin embargo, cuando tres matones toman a Lana, Jonathan y Martha como rehenes, Clark debe encontrar una manera de salvar a su familia sin sus superpoderes.
Un excompañero de Chloe le advierte que lanzará un misil y acabará con todo Villa Chica. Aún despojado de sus superpoderes, Clark enfrenta a Gabriel y recibe una bala.
Una fiesta toma un giro dramático cuando Luisa se golpea la cabeza al saltar al lago. Un misterioso nadador, viene a su rescate y deja atrás a Clark.
Lana se inscribe en la Universidad de Metropolis en último momento y debe unirse a una hermandad para tener un lugar donde vivir.
Jake Jennings, viejo amigo de Jonathan, visita a los Kent para obtener su apoyo en su reelección al Senado. Pero Jennings es el principal sospechoso por el asesinato de una mujer.
Clark se expone a kriptonita de plata, lo que lo hace tener delirios paranoicos. El elemento lo hace creer que Chloe relevará su secreto, que Jonathan hace planes contra él con Lionel y que Lex y Lana tienen una relación secreta.
Martha contrae una enfermedad extraña y le quedan horas de vida, por lo que Clark acude al profesor Fine. Sin embargo, cuando ambos llegan a la Fortaleza, el profesor Fine trata de liberar a Zod y matar a Clark.
Lex tiene información que podría destruir a Jonathan, pero antes de decidir qué hacer, recibe un disparo y cae en coma. Sueña que su madre le muestra la vida que podría tener si se aleja de su padre y LuthorCorp.
Jonathan recibe amenazas misteriosas que lo instan a abandonar la carrera senatorial. Clark encuentra a su padre malherido y decide encontrar al atacante. La vida de Luisa está en peligro.
Los oficiales que vieron aterrizar la nave espacial durante la lluvia de meteoritos toman a Lex y Lana como rehenes y amenazan con matarlos a menos que Lex revele dónde escondió la nave.
Clark le revela su secreto a Lana. Jonathan y Lex conocen los resultados de la elección senatorial. Y después de que un trágico accidente automovilístico en la carretera toma la vida de alguien que ama, Clark vuelve desesperadamente a la Fortaleza de la Soledad y le pide ayuda a Jor-El.
Clark descubre que el nuevo reportero del Daily Planet es en realidad una vengadora enmascarada que lucha contra el crimen de noche.
Luisa (encuentra un cadáver en las paredes del Talon y el espíritu de la joven se libera. Clark y Luisa deben seguir el rastro del espíritu y encontrar a su asesino, quien ha abusado de las niñas de Villa Chica durante los últimos 10 años.
Un compasivo médico libera a un sujeto mitad máquina y mitad humano llamado Victor , a quien LuthorCorp mantenía cautivo para experimentar. Mientras escapa, Victor es golpeado por el auto de Lana y se aleja sin un rasguño, por lo que Lana llama a Clark para investigar.
Al descubrir que el profesor Fine está en Honduras, Lex viaja a enfrentarlo. Mientras tanto, Clark conoce a una hermosa seductora llamada Simone que utiliza un encanto mágico para hacer que las personas sucumban a sus deseos.
Lana experimenta con un peligroso suero que le permite ir al más allá y volver a ver a sus padres muertos. Clark se apresura a salvar a Lana de lastimarse a sí misma, pero termina siendo inyectado con kriptonita por un arrogante estudiante de medicina.
Clark y Martha cuidan a una niña tras la muerte de su madre por una brutal apuñalada. Sin embargo, después de que se descubre que Maddie tiene el poder de romper el vidrio, se convierte en el principal sospechoso.
Un torturador encapuchado toma a Lionel como rehén y orquesta una serie de juegos elaborados que Lionel debe ganar para mantenerse vivo.
Mientras está en Metropolis, Clark salva la vida de un extraño quien se compromete a pagarle por su amabilidad. Desafortunadamente, el hombre termina siendo un asesino con la capacidad de ocultarse y decide que matar a Lex sería el mejor regalo que le podría dar a Clark.
Clark se sorprende al ver el fantasma de su padre en el cementerio, pero queda aún más confundido cuando Jonathan le dice que mate a Lionel.
Fine libera un virus que podría matar a millones y se niega a entregar la vacuna a Clark a menos que libere a un criminal kriptoniano encarcelado. Mientras tanto, Lex comparte un descubrimiento con Lana, quien decide apoyarlo sin saber que la vida de Lex está a punto de tomar un giro inesperado.