Leo, Raph, Donnie y Mikey son cuatro hermanos con habilidades extraordinarias desde pequeños, éstos han tenido una vida llena de dificultades, pero hasta ahora han logrado salir adelante gracias a su trabajo en equipo. Sólo que la nueva travesía que les depara les mostrará otro tipo de caminos, pues ahora los cuatro deberán separarse, en un inicio esto les parecerá aterrador ya que estaban acostumbrados a estar siempre juntos, pero pronto se darán cuenta que él estar solos por primera vez les mostrará quienes realmente son. Raph, Donnie, Mikey y Leo tienen a diversos enemigos a su alrededor por lo que tendrán que hacerse de aliados de confianza e incluso volverán a reunirse con viejos conocidos con quienes harán equipo para cuando las amenazas que surjan se vuelvan sumamente peligrosas.
