Tetsuya Kuroko se incorpora a un nuevo colegio llamado Instituto Seirin y de inmediato se une al equipo de baloncesto. Una vez dentro, conoce a Kagami Taiga, un jugador excepcional recién llegado de América que tiene sed de victoria. Juntos se proponen convertir a su equipo medianamente bueno en uno de los mejores de la liga adolescente Intehigh. No obstante, no será tarea fácil, ya que se enfrentarán a los ex compañeros de Kuroko, y él sabe de primera mano que el talento es lo que caracteriza a sus rivales, y todos se encuentran en equipos de primera categoría. Estos cinco jugadores son tan buenos al grado que se les conoce como la ‘Generación de los milagros’, título que obtuvieron después de ganar un importante torneo por tres años consecutivos durante su estancia en la secundaria Teiko. Lo que pocos saben es que no sólo existen cinco superestrellas del baloncesto; una sexta pasó desapercibido ya que siempre fue el suplente y no tuvo oportunidad de demostrar sus habilidades. Sin embargo, ha regresado con un perfil bajo y está listo para derrotar a estos eruditos del deporte. Se trata nada más y nada menos que de Kuroko, quien ahora es el arma secreta del equipo de Seirin.
