Esta tercera temporada pondrá al límite a todos los habitantes de Tree Hill. Al fin ha llegado el último día de preparatoria para Lucas, Nathan, Peyton, Brooke y ahora Haley será la quien luchará por recuperar su relación a un lado de Nathan, quien no la perdonará tan fácilmente. Como es el último año antes de ingresar a la universidad, todos están rodeados de varias presiones y expectativas, cada uno de los chicos y chicas buscan cumplir sus objetivos y poder tener algo mejor en el futuro. En cuanto a los adultos, Dan logra encontrar a la persona responsable que casi lo mata por haber provocado el incendio, así que planeará la forma de hacerle pagar por esto. También Keith regresa a casa y una nueva chica aparece en el instituto, ella podría causar varios problemas, pero a todos los alumnos de Tree Hill les aguarda una terrible sorpresa.