El actor de Batman y Top Gun, es practicante de la llamada ciencia cristiana (que no es ciencia), desde que era pequeño.
Su devoción, le llevó a crear una obra sobre Mary Baker Eddy, la fundadora de esta iglesia donde para ellos, las leyes de dios, curan enfermedades… Se sabe que en 2016, Kilmer se negó inicialmente a recibir tratamiento por un tumor que tenía en la garganta debido a sus creencias, pero finalmente accedió a ser tratado.