En 2013, Shannon Murphy recibió su diploma de posgrado en dirección de la Escuela Australiana de Cine, Televisión y Radio. Su cortometraje de graduación, Kharisma (2014), se proyectó en el Festival de Cine de Cannes. Dos años más tarde, su cortometraje Eaglehawk (2016) fue seleccionado para los Premios Dendy en el Festival de Cine de Sydney en 2016. Su primer largometraje, Babyteeth (2019), protagonizado por Eliza Scanlen, sigue la historia de una adolescente con una enfermedad terminal que se enamora de un traficante de drogas, la peor pesadilla de sus padres. Babyteeth fue nominada a mejor película en el Festival de Cine de Venecia de 2019. En 2020, Murphy dirigió los episodios cinco y seis de la tercera temporada de Killing Eve.