Juan Francisco Ayala nació el 21 de mayo de 1972 en la Ciudad de México. Se inició en la escena musical a temprana edad al participar en un grupo infantil llamado Din-Din de la que formó parte hasta que cumplió los once años. Interesado por desarrollar su talento artístico empezó a estudiar música, pero lo abandonó a los dos años de haber iniciado para unirse a diversas bandas de heavy metal.
Cuando Jay de la Cueva salió de la agrupación Molotov, Paco Ayala se unió a ella, completando el grupo para tocar el bajo (aunque también toca la guitarra y el acordeón). En 2007 lanzó un disco como solista llamado “El Plan de Ayala”.
Para cine ha participado en la musicalización de cintas como Un día sin mexicanos (2004), Isi & Disi, alto voltaje y Rampart (2011). Ha aparecido también en cintas documentales como Gimme the Power (2012), Hecho en México (2012) y Molotov 20 años: días de peda y cruda (2016).