Austin Stowell estudió con el Departamento de Arte Dramático, una división de la Escuela de Bellas Artes de la Universidad de Connecticut en Storrs. Actuó en varias producciones con el Connecticut Repertory Theatre, incluyendo Julius Caesar, It Can't Happen Here y As You Like It. Stowell se graduó con una Licenciatura en Bellas Artes en 2007. Sus primeras apariciones en pantalla fueron en el 2009, año en el que fue elgido para interpretar el papel de Jesse en la serie de drama adolescente The Secret Life of the American Teenager, entre su segunda y cuarta temporada. En pantalla grande, Stowell participó en la película familiar Winter - El delfín (2011) y su secuela de 2014 Winter - El delfín 2, tuvo un papel importante en la galardonada película de Damien Chazelle Whiplash (2014) y participó en Puente de espías (2015), película histórica protagonizada por Tom Hanks. En 2020, Stowell participa en la cinta de terror La isla de la fantasía.