Después de comprar su propio equipo de producción, Chris McKay trabajó durante tres años filmando y editando videos musicales, videos industriales y películas locales. McKay editó por primera vez una película de uno de sus amigos, titulada Kwik Stop (2001). En 2004 se mudó a Los Ángeles y consiguió un trabajo de edición en el estudio de animación ShadowMachine. Comenzó a trabajar en el primer episodio de Robot Chicken (2005-), una serie de televisión de comedia animada para adultos, creada por Seth Green y Matthew Senreich, por la que ganó un Emmy en 2005. Trabajó como codirector de animación en La gran aventura Lego (2014) con Phil Lord y Christopher Miller; mientras los directores trabajaban en Comando especial 2 (2014), enviaron a McKay a Australia para supervisar toda la animación, edición, efectos, iluminación y representación de la película. Hizo su debut como director de largometraje con LEGO Batman: La película (2017). También dirigirá la secuela programada para 2022 y la película de live action de Nightwing.
